Apa yang dimaksud Agrobacterium tumefaciens?

Transformasi genetik adalah proses introduksi gen dari satu organisme ke organisme lain yang memungkinkan untuk memunculkan sifat harapan tanpa mengubah sifat lain. Penggunaan Agrobacterium tumefaciens sebagai vektor transformasi memiliki keunggulan karena tidak membutuhkan peralatan khusus serta efisiensi transformasi dan salinan tunggal dari gen yang ditransformasi relatif tinggi. Penelitian ini merupakan penelitian transformasi komparatif pada beberapa tanaman yang memiliki karakter berbeda, yaitu manggis sebagai tanaman apomiksis, tembakau sebagai tanaman model, anggrek sebagai perwakilan dari kelas monokotil, dan kopi sebagai perwakilan dari kelas dikotil. Transformasi dilakukan dengan metode yang sama dan dilanjutkan dengan regenerasi pada media seleksi yang mengandung antibiotik. Konfirmasi sisipan gen hasil transformasi dilakukan dengan teknik Polimerase Chain Reaction (PCR). Hasil konfirmasi dari sampel tanaman yang mampu tumbuh pada media seleksi menunjukkan hanya tembakau yang positif tersisipi oleh gen yang ditransfomasi. Hal ini menunjukkan bahwa tanaman hasil transformasi yang mampu hidup di media seleksi belum merupakan jaminan tersisip oleh gen yang diintroduksi sebelum dilakukan pengujian molekuler. Beberapa optimasi dalam sterilisasi, teknik infeksi, peningkatan jumlah eksplan yang ditransformasi dan jumlah sampel yang diuji perlu dilakukan untuk peningkatan efisiensi transformasi.

Agrobacterium tumefaciens adalah bakteri patogen terhadap tanaman dikotil. Jika suatu tanaman dikotil terinfeksi oleh bakteri ini maka akan terbentuk tumor yang disebut crown gall. Kemampuan membentuk tumor ditentukan oleh plasmid Ti yang ada dalam  A. tumefaciens. Plasmid Ti mengandung suatu fragmen DNA yang disebut T-DNA (berukuran 15-30 kb) yang dapat diintegrasikan ke dalam DNA inti sel tanaman. Oleh karena itu plasmid Ti selanjutnya dikembangkan sebagai vektor untuk memasukkan DNA asing ke dalam sel tanaman.

     Proses rekayasa genetika dilakukan dengan terlebih dahulu mengisolasi DNA yang akan disisipkan. DNA asing disisipkan ke dalam vektor plasmid Ti sehingga akan terjadi rekombinasi pada fragmen T-DNA pada plasmid Ti. Plasmid Ti dimasukkan kembali ke dalam A. tumefaciens. Pada waktu  A. tumefaciens  menginfeksi sel tanaman, plasmid Ti rekombinan akan mengintegrasikan bagian T-DNA ke dalam DNA inti sel tanaman. Dengan demikian DNA asing tersebut akan ikut terintegrasikan ke dalam genom tanaman. Rekayasa genetika dengan menggunakan plasmid Ti dapat dilihat sebagai berikut.

Agrobacterium tumefaciens
Apa yang dimaksud Agrobacterium tumefaciens?

Agrobacterium tumefaciens yang sedang meninfeksi sel wortel.

Klasifikasi ilmiah
Kerajaan:Bacteria
Filum:Proteobacteria
Kelas:Alpha Proteobacteria
Ordo:Rhizobiales
Famili:Rhizobiaceae
Genus:Agrobacterium
Spesies:A. tumefaciens
Nama binomial
Agrobacterium tumefaciens
Smith & Townsend, 1907
Sinonim

Bacterium tumefaciens Smith and Townsend 1907
Pseudomonas tumefaciens (Smith and Townsend 1907) Duggar 1909
Phytomonas tumefaciens (Smith and Townsend 1907) Bergey et al. 1923
Polymonas tumefaciens (Smith and Townsend 1907) Lieske 1928


Agrobacterium tumefaciens adalah bakteri patogen pada tanaman yang banyak dipakai sebagai memasukkan gen asing ke dalam sel tanaman sebagai menghasilkan suatu tanaman transgenik.[1] Bakteri ini dipopulerkan oleh Mary-Dell Chilton sejak tahun 1977 melewati penelitiannya. Secara alami, A. tumefaciens dapat menginfeksi tanaman dikotiledon melewati babak tanaman yang terluka sehingga menyebabkan tumor mahkota empedu (crown gall tumor).[1] Bakteri yang tergolong ke dalam gram negatif ini mempunyai sebuah plasmid agung yang dinamakan plasmid-Ti yang mengandung gen penyandi faktor virulensi penyebab infeksi bakteri ini pada tanaman.[2] Sebagai memulai pembentukan tumor, A. tumefaciens harus menempel terlebih dahulu pada permukaan sel inang dengan menggunakan polisakarida asam yang akan dipakai sebagai mengkoloniasi/menguasai sel tanaman.[1] Selain tanaman dikotiledon, tanaman monokotiledon seperti jagung, gandum, dan tebu sudah dipakai sebagai memasukkan sel asing ke dalam genom tanaman.[1] Agrobacterium tumefaciens adalah bakteri patogen pada tanaman yang banyak dipakai sebagai memasukkan gen asing ke dalam sel tanaman sebagai menghasilkan suatu tanaman transgenik.[1]

Referensi


edunitas.com


Page 2

Tags (tagged): agrobacterium tumefaciens, unkris, smith townsend, 1907, sinonim bacterium tumefaciens, oleh mary, dell, chilton sejak tahun, 1977 melalui, harus, menempel terlebih dahulu, pada permukaan, sel, inang, tanaman transgenik, referensi a, b, c d e, inggris gustavo, a, de, center of, studies artikel, judul, nama binomial semua, regnum bacteria, agrobacterium, tumefaciens, program kuliah, pegawai, kelas, weekend, studies, kelas eksekutif, indonesian, encyclopedia


Page 3

Tags (tagged): agrobacterium tumefaciens, unkris, smith townsend, 1907, sinonim bacterium tumefaciens, oleh mary, dell, chilton sejak tahun, 1977 melalui, harus, menempel terlebih dahulu, pada permukaan, sel, inang, tanaman transgenik, referensi a, b, c d e, inggris gustavo, a, de, center of, studies artikel, judul, nama binomial semua, regnum bacteria, agrobacterium, tumefaciens, program kuliah, pegawai, kelas, weekend, studies, kelas eksekutif, indonesian, encyclopedia


Page 4

Tags (tagged): agrobacterium tumefaciens, unkris, smith townsend, 1907, sinonim bacterium tumefaciens, oleh mary, dell, chilton sejak tahun, 1977 melalui, harus, menempel terlebih dahulu, pada permukaan, sel, inang, tanaman transgenik, referensi a, b, c d e, inggris gustavo, a, de, pusat ilmu, pengetahuan artikel, judul, nama binomial semua, regnum bacteria, agrobacterium, tumefaciens, program kuliah, pegawai, kelas, weekend, pengetahuan, kelas eksekutif, ensiklopedi, bahasa indonesia, ensiklopedia


Page 5

Tags (tagged): agrobacterium tumefaciens, unkris, smith townsend, 1907, sinonim bacterium tumefaciens, oleh mary, dell, chilton sejak tahun, 1977 melalui, harus, menempel terlebih dahulu, pada permukaan, sel, inang, tanaman transgenik, referensi a, b, c d e, inggris gustavo, a, de, pusat ilmu, pengetahuan artikel, judul, nama binomial semua, regnum bacteria, agrobacterium, tumefaciens, program kuliah, pegawai, kelas, weekend, pengetahuan, kelas eksekutif, ensiklopedi, bahasa indonesia, ensiklopedia


Page 6

Agrobacterium adalah suatu marga bakteri Gram-negatif yang masih memiliki hubungan dengan bakteri-bakteri bintil akar. Marga ini diperkenalkan oleh H. J. Conn dan diketahui mampu menimbulkan tumor pada jaringan tumbuhan dengan cara transfer gen hirozontal. Agrobacterium tumefaciens adalah spesies model sebagai transformasi genetik dan sangat banyak dipakai dalam penelitian-penelitian bioteknologi pertanian, khususnya sebagai kebutuhan rekayasa genetik.

Agrobacterium diketahui bersifat heterogen. Kajian taksonomi terbaru telah mengelompokkan ulang anggota-anggotanya ke dalam marga-marga lain, seperti Ruegeria, Pseudorhodobacter, dan Stappia, tetapi sebagian akbar diisi ke dalam Rhizobium.


edunitas.com


Page 7

Agrobacterium adalah suatu marga bakteri Gram-negatif yang masih memiliki hubungan dengan bakteri-bakteri bintil akar. Marga ini dikenalkan oleh H. J. Conn dan diketahui mampu menimbulkan tumor pada jaringan tumbuhan dengan cara transfer gen hirozontal. Agrobacterium tumefaciens adalah spesies model sebagai transformasi genetik dan sangat banyak dipakai dalam penelitian-penelitian bioteknologi pertanian, khususnya sebagai kebutuhan rekayasa genetik.

Agrobacterium diketahui bersifat heterogen. Kajian taksonomi terbaru telah mengelompokkan ulang anggota-anggotanya ke dalam marga-marga lain, seperti Ruegeria, Pseudorhodobacter, dan Stappia, tetapi sebagian akbar diisi ke dalam Rhizobium.


edunitas.com


Page 8

Agrobacterium adalah suatu marga bakteri Gram-negatif yang masih memiliki hubungan dengan bakteri-bakteri bintil akar. Marga ini dikenalkan oleh H. J. Conn dan diketahui mampu menimbulkan tumor pada jaringan tumbuhan dengan cara transfer gen hirozontal. Agrobacterium tumefaciens adalah spesies model sebagai transformasi genetik dan sangat banyak dipakai dalam penelitian-penelitian bioteknologi pertanian, khususnya sebagai kebutuhan rekayasa genetik.

Agrobacterium diketahui bersifat heterogen. Kajian taksonomi terbaru telah mengelompokkan ulang anggota-anggotanya ke dalam marga-marga lain, seperti Ruegeria, Pseudorhodobacter, dan Stappia, tetapi sebagian akbar diisi ke dalam Rhizobium.


edunitas.com


Page 9

Agrobacterium adalah suatu marga bakteri Gram-negatif yang masih memiliki hubungan dengan bakteri-bakteri bintil akar. Marga ini diperkenalkan oleh H. J. Conn dan diketahui mampu menimbulkan tumor pada jaringan tumbuhan dengan cara transfer gen hirozontal. Agrobacterium tumefaciens adalah spesies model sebagai transformasi genetik dan sangat banyak dipakai dalam penelitian-penelitian bioteknologi pertanian, khususnya sebagai kebutuhan rekayasa genetik.

Agrobacterium diketahui bersifat heterogen. Kajian taksonomi terbaru telah mengelompokkan ulang anggota-anggotanya ke dalam marga-marga lain, seperti Ruegeria, Pseudorhodobacter, dan Stappia, tetapi sebagian akbar diisi ke dalam Rhizobium.


edunitas.com


Page 10

Tags (tagged): 2 Title of articles, 2002 FIFA World Cup Qualifying - European Zone Group 5, 2002 FIFA World Cup Qualifying - European Zone Group 7, 2002 FIFA World Cup Qualifying - European Zone Group 8, 2002 FIFA World Cup Qualifying - European Zone Group 9, 2006 FIFA World Cup Qualifying - Final Round Zone North, Central America and the Caribbean, 2006 FIFA World Cup Qualifying - First round African Zone, 2006 FIFA World Cup Qualifying - First round of Asian Zone, 2006 FIFA World Cup Qualifying - Qualifying Zone North, Central America and the Caribbean, 2011 AFC Cup, 2011 Asian Cup, 2011 CONCACAF Gold Cup, 2011 Copa America squad, 2014 FIFA World Cup Qualifying - Second Round Zone North, Central America and the Caribbean, 2014 FIFA World Cup Qualifying - Third Round Zone North, Central America and the Caribbean, 2014 FIFA World Cup squads, 2014 Winter Olympics, 27 September, 270, 273 BC, 28


Page 11

Tags (tagged): 2 Title of articles, 2002 FIFA World Cup Qualifying - European Zone Group 5, 2002 FIFA World Cup Qualifying - European Zone Group 7, 2002 FIFA World Cup Qualifying - European Zone Group 8, 2002 FIFA World Cup Qualifying - European Zone Group 9, 2006 FIFA World Cup Qualifying - Final Round Zone North, Central America and the Caribbean, 2006 FIFA World Cup Qualifying - First round African Zone, 2006 FIFA World Cup Qualifying - First round of Asian Zone, 2006 FIFA World Cup Qualifying - Qualifying Zone North, Central America and the Caribbean, 2011 AFC Cup, 2011 Asian Cup, 2011 CONCACAF Gold Cup, 2011 Copa America squad, 2014 FIFA World Cup Qualifying - Second Round Zone North, Central America and the Caribbean, 2014 FIFA World Cup Qualifying - Third Round Zone North, Central America and the Caribbean, 2014 FIFA World Cup squads, 2014 Winter Olympics, 27 September, 270, 273 BC, 28


Page 12

Tags (tagged): F Title of articles, F/A-18 Hornet, F1 2011 European Grand Prix, F1 Brazilian Grand Prix 2003, F1 Brazilian Grand Prix 2009, FC Sion, FC Slavyansky Slavyansk-na-Kubani, FC Slovan Liberec, FC Smena Komsomolsk-na-Amure, FIFA Ballon d' Or 2011, FIFA Ballon d'Or, FIFA Ballon d'Or 2012, FIFA Ballon d'Or 2013, Flag of Slovakia, Flag of Slovenia, Flag of Solomon Islands, Flag of Somalia, foster brother, Fotodiode, Fouad Rachid, Foued Kadir


Page 13

Tags (tagged): F Title of articles, F/A-18 Hornet, F1 2011 European Grand Prix, F1 Brazilian Grand Prix 2003, F1 Brazilian Grand Prix 2009, FC Sion, FC Slavyansky Slavyansk-na-Kubani, FC Slovan Liberec, FC Smena Komsomolsk-na-Amure, FIFA Ballon d' Or 2011, FIFA Ballon d'Or, FIFA Ballon d'Or 2012, FIFA Ballon d'Or 2013, Flag of Slovakia, Flag of Slovenia, Flag of Solomon Islands, Flag of Somalia, foster brother, Fotodiode, Fouad Rachid, Foued Kadir


Page 14

Tags (tagged): G Title of articles, Gary Andrew Stevens, Gary Breen, Gary Cahill, Gary Caldwell, Georginio Wijnaldum, Georgios George Koumantarakis, Georgios Karagounis, Georgios Samaras, Giuseppe Wilson, giussano, Givi Chokheli, Givi Dmitriyevich Chokheli, Granze, graph, grapheme, graphic, Gunter Friesenbichler, Gunungkidul Persig, Gunungsitoli, Gupta script


Page 15

Tags (tagged): G Title of articles, Gary Andrew Stevens, Gary Breen, Gary Cahill, Gary Caldwell, Georginio Wijnaldum, Georgios George Koumantarakis, Georgios Karagounis, Georgios Samaras, Giuseppe Wilson, giussano, Givi Chokheli, Givi Dmitriyevich Chokheli, Granze, graph, grapheme, graphic, Gunter Friesenbichler, Gunungkidul Persig, Gunungsitoli, Gupta script


Page 16

Tags (tagged): H Title of articles, Half-Blood Prince (character), Hali, halide, Halil Altintop, Harut and Marut, harvest, Harvesters combination, harvesting, Henk Bos (football player), Henk Ngantung, Henk Pellikaan, Henk Sneevliet, Hirofumi Moriyasu, Hirohito, Hiroki Sakai, Hiroshi Kiyotake, Houssine Kharja, Houston, Houston Dynamo, Houston Texans


Page 17

Tags (tagged): H Title of articles, Half-Blood Prince (character), Hali, halide, Halil Altintop, Harut and Marut, harvest, Harvesters combination, harvesting, Henk Bos (football player), Henk Ngantung, Henk Pellikaan, Henk Sneevliet, Hirofumi Moriyasu, Hirohito, Hiroki Sakai, Hiroshi Kiyotake, Houssine Kharja, Houston, Houston Dynamo, Houston Texans


Page 18

Tags (tagged): I Title of articles, Ibrahima Traore, Ibrox Stadium, Ibu Kota Beijing International Airport, Ibu Tien, Independiente, Index Kompas100, Index of Economic Freedom, India, Indonesian Young, Indonesian Youth Party, Indonesian ZALORA, Indonesias Got Talent, Internet Movie Database, Internet protocol, Internet protocol suite, Internet protocol television, ISO 3166-2, ISO 3166-2 : PH, ISO 3166-2 GB, ISO 4217


Page 19

Tags (tagged): I Title of articles, Ibrahima Traore, Ibrox Stadium, Ibu Kota Beijing International Airport, Ibu Tien, Independiente, Index Kompas100, Index of Economic Freedom, India, Indonesian Young, Indonesian Youth Party, Indonesian ZALORA, Indonesias Got Talent, Internet Movie Database, Internet protocol, Internet protocol suite, Internet protocol television, ISO 3166-2, ISO 3166-2 : PH, ISO 3166-2 GB, ISO 4217


Page 20

Tags (tagged): J Title of articles, Jabu Mahlangu, Jabu Pule, Jaca, Jacatra, January, January 1, January 10, January 11, Jens Bertelsen, Jens Hegeler, Jens Janse, Jens Jeremies, Johan Devrindt, Johan Djourou, Johan Elmander, Johan Hendrik Caspar Kern, Jorge Larrionda, Jorge Lobo Carrascosa, Jorge Luis Burruchaga, Jorge Luis Pinto


Page 21

Tags (tagged): J Title of articles, Jabu Mahlangu, Jabu Pule, Jaca, Jacatra, January, January 1, January 10, January 11, Jens Bertelsen, Jens Hegeler, Jens Janse, Jens Jeremies, Johan Devrindt, Johan Djourou, Johan Elmander, Johan Hendrik Caspar Kern, Jorge Larrionda, Jorge Lobo Carrascosa, Jorge Luis Burruchaga, Jorge Luis Pinto


Page 22

Tags (tagged): K Title of articles, Karl Erik Algot Almgren, Karl Gosta Herbert Lofgren, Karl Henry, Karl Hohmann, Kerkrade, Kermes ilicis, Kern County, California, Kernel (computer science), King of Bahrain Cup 2012, King of Bandits Jing, King Osanga, King Power Stadium, Konstantinos Mitroglou, Konstanz, Konya, Koo Ja-Cheol, Kwandang, North Gorontalo, Kwasi Appiah, KY, Kyai


Page 23

Tags (tagged): K Title of articles, Karl Erik Algot Almgren, Karl Gosta Herbert Lofgren, Karl Henry, Karl Hohmann, Kerkrade, Kermes ilicis, Kern County, California, Kernel (computer science), King of Bahrain Cup 2012, King of Bandits Jing, King Osanga, King Power Stadium, Konstantinos Mitroglou, Konstanz, Konya, Koo Ja-Cheol, Kwandang, North Gorontalo, Kwasi Appiah, KY, Kyai


Page 24

Tags (tagged): L Title of articles, La Romareda, La Romareda Stadium, La Rosaleda Stadium, La Spezia, Laureano Sanabria Ruiz, Lauren, Lauren Colthorpe, Lauren Etame Mayer, lesions, Lesley de Sa, lesmo, Lesotho, List of counties and cities in Central Java, List of counties and cities in Central Kalimantan, List of counties and cities in Central Sulawesi, List of counties and cities in East Java, List of Indonesian leaders, List of Indonesian legendary football player, List of Indonesian local clothing, List of Indonesian minister


Page 25

Tags (tagged): L Title of articles, La Romareda, La Romareda Stadium, La Rosaleda Stadium, La Spezia, Laureano Sanabria Ruiz, Lauren, Lauren Colthorpe, Lauren Etame Mayer, lesions, Lesley de Sa, lesmo, Lesotho, List of counties and cities in Central Java, List of counties and cities in Central Kalimantan, List of counties and cities in Central Sulawesi, List of counties and cities in East Java, List of Indonesian leaders, List of Indonesian legendary football player, List of Indonesian local clothing, List of Indonesian minister


Page 26

Tags (tagged): O Title of articles, Obu, Aichi- Obu, Aichi, Occidental Mindoro, Occimiano, Occitania, OIC, OIC Islamic University, Oier Olazabal, Oier Sanjurjo, Olympic Stadium Berlin, Olympic Stadium Fisht, Olympic Stadium San Marino, Olympic Stadium, Munich, Orchid, Orchidaceae, Orchids, North Gorontalo, Order of Carmelites, Oskemen, Oslo, Oslo Peace Agreement, Osman Chavez